以危险方法危害公共安全罪：刑法第114条、第115条。交通肇事罪：刑法第133条 违反交通运输管理法规，造成重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的行为。
联系：都属于危害公共安全罪。
区别：1、客观方面
以危险方法危害公共安全罪：第一，其他危险方法是指放火、决水、爆炸、投放危险物质以外的危险方法;第二，其他危险方法应理解为与放火、决水、爆炸、投放危险物质的危险性相当的、足以危害公共安全的方法，即这种危险方法一经实施就可能造成或造成不特定多数人的伤亡或重大公私财产的毁损;第三，其他危险方法应当理解为，是现行刑法没有明确规定的危险方法犯罪，即刑法分则第二章危害公共安全罪中已经涉及到的具体罪名规定的行为之外的其他行为。否则就应当以刑法规定的具体罪名予以定罪，而不以本罪定罪处罚。
交通肇事罪：违反交通运输法规。
最高人民法院下发《关于印发醉酒驾车犯罪法律适用问题指导意见及相关典型案例的通知》，指出：行为人明知酒后驾车违法，醉酒驾车会危害公共安全，却无视法律醉酒驾车，特别是在肇事后继续驾车冲撞，造成重大伤亡，说明行为人主观上对持续发生的危害结果持放任态度，且有危害公共安全的故意，对此类醉酒驾车造成重大伤亡的，应依法以危险方法危害公共安全罪定罪。
2、行为人的主观心态
以危险方法危害公共安全罪是故意犯罪，行为人明知其行为会造成或者有可能造成严重的后果，却希望或者放任这种结果的发生。
交通肇事罪在主观方面只能是过失，即行为人在主观上不希望发生危害社会的严重后果，但是应当预见或者因疏忽大意而没有预见或者轻信能够避免，自己的行为可能引起危害公共安全的严重后果。
3、在“结果犯”和“状态犯”上的区别。
“交通肇事罪”不处罚状态犯，只触罚结果犯，“以危险方法危害公共安全罪”既处罚状态犯又处罚结果犯。
4、法定量刑幅度
《刑法》第一百一十四条、第一百一十五条规定，以危险方法危害公共安全，尚未造成严重后果的，处三年以上十年以下有期徒刑;致人重伤、死亡或者便公私财产遭受重大损失的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑
第一百三十三条规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役;交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑;因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。